Partnerluskogu juhatusse kuulub igast omavalitsuspiirkonnast üks liige ning lähtudes põhikirjast peab omavalitsuste esindajate osakaal juhatuses jääma alla poole. Praegu on juhatuse koosseis järgmine:

Juhatuse esimees
Ermo Kruuse (Põrgumäe talu, Palupera vald)
juhatuse esimees
Telefon 511 3543
E-post See e-posti aadress on kaitstud spämmirobotide vastu. E-posti aadressi nägemiseks peab olema JavaSkripti kasutamine olema lubatud.

Juhatuse aseesimehed
Tõnu Saarman (Sangaste Vallavalitsus, Sangaste vald)
Ene Kaas (Lüllemäe Rahvaõpistu, Karula vald)

Juhatuse liikmed
Aivar Uibu (Põdrala Vallavalitsus, Põdrala vald)
Maido Ruusmann (Tõrva Linnavalitsus, Tõrva linn)
Tarmo Tamm (Helme Vallavalitsus, Helme vald)
Kaido Purason (OÜ Mändre Post, Hummuli vald)
Eve Ilisson (SA Taheva Sanatoorium, Taheva vald)
Annika Jaansoo (Meie Otepää MTÜ, Otepää vald)
Mati Raud (MTÜ Spordiklubi Raudsõrmus, Tõlliste vald)
Kaja Papagoi (MTÜ Lotamõisa Arendus, Õru vald)
Helgi Pung (Puka Naisselts, Puka vald)